Cell重磅研究!工程益生菌重塑肠-肝-脑轴,开启肝性脑病精准治疗新篇章

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近日,一项发表于国际顶级期刊《Cell》的最新研究,为肝性脑病(HE)这一困扰全球众多肝病患者的严重并发症带来了全新的治疗曙光。来自新加坡国立大学等机构的科研团队,成功利用合成生物学工具,将常见的肠道共生菌——植物乳杆菌,改造为高效的“代谢调节器”。这两种工程菌株能够精准靶向肝性脑病核心病理机制,在动物模型中显著降低血液与大脑中的氨水平,改善神经行为异常,且不破坏肠道菌群稳态,疗效甚至超越现有临床一线药物,这标志着活体生物疗法在治疗复杂代谢-神经疾病领域迈出了关键一步。

图形摘要
研究背景:当前治疗困境与全新策略
肝性脑病是肝硬化的常见终末期并发症,患者因肝脏解毒功能衰竭,导致血液中氨等毒性物质累积,穿越血脑屏障引发神经认知障碍甚至昏迷。目前临床标准疗法为乳果糖和非吸收性抗生素利福昔明,它们主要通过降低肠道细菌产氨来起效。然而,这些疗法存在腹泻、电解质紊乱、诱导抗生素耐药及无法恢复支链氨基酸(BCAA)与谷氨酰胺平衡等局限。
研究团队敏锐地指出,肝性脑病的核心是一个涉及氨、BCAA和谷氨酰胺三种关键代谢物的恶性循环。现有疗法仅针对单一环节。研究团队提出了一种整合性策略:开发能够同时消耗氨、生产BCAA、并代谢谷氨酰胺的工程共生菌,从多通路协同纠正代谢失衡。
研究设计:基因工程改造菌株
研究团队选择安全性高、遗传背景清晰的植物乳杆菌WCFS1作为底盘菌,进行了精密的基因工程改造:
Lp-NH3菌株:研究人员构建了一条全新的合成代谢通路,使该菌能够直接利用环境中的氨作为氮源,将其与丙酮酸结合,高效合成并分泌支链氨基酸。为此,他们不仅引入了外源基因,还敲除了细胞内竞争性代谢路径,并优化了关键酶的表达水平,最终成功打造出“氨消耗-BCAA生产”的微生物工厂。
Lp-Q菌株:该菌株通过基因编辑,增强了其天然代谢谷氨酰胺的能力。研究人员过表达了特定的谷氨酰胺利用酶,并引入了一个“代谢下沉”模块,以解除谷氨酰胺代谢产物可能带来的反馈抑制,从而持续高效地消耗L-谷氨酰胺,从源头减少其水解生成新氨的可能性。
动物实验:多重效果惊人
在两种临床前肝性脑病小鼠模型(高氨饮食诱导模型和胆管结扎模型)中,口服这两种工程菌株(单独或联合)展现了令人鼓舞的疗效:
强效降氨:工程菌株,特别是Lp-NH3及其与Lp-Q的联合使用,能够将血清氨水平降低高达10倍,效果优于利福昔明。
恢复代谢平衡:Lp-NH3治疗显著提升了血清和大脑中的BCAA水平;Lp-Q则有效降低了血清谷氨酰胺。联合疗法能同时优化这三种关键代谢物的水平。
改善神经行为:行为学测试表明,接受工程菌株治疗的小鼠,其焦虑样行为得到显著改善。在胆管结扎模型中,Lp-NH3+Q联合疗法表现出最佳的神经行为恢复效果。
重塑大脑转录组:对大脑组织的RNA测序分析发现,工程菌株治疗能部分逆转疾病导致的基因表达紊乱,特别是与G蛋白偶联受体信号、单胺能神经元功能相关的通路得到恢复,神经炎症相关基因表达下降,这从分子层面解释了行为改善的机制。
保护肠道微生态:与广谱抗生素利福昔明显著降低肠道菌群多样性和丰度不同,工程植物乳杆菌治疗基本保留了宿主原有的肠道菌群结构和多样性,这对长期治疗的安全性至关重要。
良好的安全性:长期给药研究表明,工程菌株耐受性良好,停药后72小时内即从肠道中被快速清除,未发生致病性传播或引发系统性炎症。
研究意义与未来展望
研究表明,可以对共生细菌进行编程,使其在肠道内执行复杂的多靶点代谢任务。这为干预肠-肝-脑轴相关的复杂疾病提供了一个模块化、可编程的治疗平台。该研究不仅为肝性脑病提供了一种极具潜力的新型疗法,其“多代谢物同步调节”的策略,也为其他与肠道微生物代谢失调相关的疾病带来了新的治疗思路。
原文链接:
https://www.nature.com/articles/s41392-026-02635-2
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