Nature子刊:黄河团队系统揭示赖氨酸丙酮酰化修饰及其调控机制


编辑丨王多鱼
排版丨水成文
蛋白质翻译后修饰(PTM)动态调控蛋白质功能,其中代谢物驱动的 PTM 将代谢与蛋白质调控联系起来。黄河等人此前发现了赖氨酸乳酸化修饰(lysine lactylation,简称为 Kla),揭示了乳酸可以直接修饰蛋白质并影响癌症进展。
最近,另一种糖酵解代谢物丙酮酸也被证明可以直接修饰 STAT1 蛋白第 201 位赖氨酸,从而抑制 I 型干扰素信号通路。然而,调控这一修饰的酶、其底物谱以及其在先天免疫之外可能发挥的作用,目前仍完全未知。

在这项最新研究中,研究团队报告了对赖氨酸丙酮酰化修饰(Lysine pyruvylation,简称为 Kpy)的系统性表征。
通过生物化学和蛋白质组学方法,研究团队证实了赖氨酸丙酮酰化修饰(Kpy)的广泛存在,并在哺乳动物细胞中鉴定出 88 个 Kpy 位点(10个组蛋白 Kpy 位点和 78 个非组蛋白 Kpy 位点)。研究团队进一步探索了 Kpy 在代谢扰动下的动态调控,发现 Kpy 随糖酵解通量和丙酮酸水平的变化而波动。此外,该研究还确定了去乙酰化酶 SIRT3 负责去除 Kpy,而组蛋白乙酰转移酶 HAT1 和 p300 则催化形成 Kpy。这些发现首次为 Kpy 确立了完整的“写入-擦除”调控环路,揭示了其动态平衡的酶学基础。
最后,研究团队探索了 Kpy在 转录调控中的功能,发现其在基因启动子区域显著富集,且 Kpy 能够驱动特定靶基因(例如 FGFR4、LGALS8、RSPH4A 等)的转录激活,初步揭示了 Kpy 在基因表达调控中的功能。

总的来说,赖氨酸丙酮酰化修饰(Kpy)扩展了代谢物驱动的蛋白质翻译后修饰种类,并为丙酮酸直接调控蛋白质功能提供了新见解。
值得一提的是,Nature Metabolism 期刊同期发表了题为:Pyruvate leaves its mark on chromatin 的 News & Views 文章,文章指出,赖氨酸丙酮酰化修饰(Kpy)是一种新发现的组蛋白修饰,由 HAT1 和 p300 催化添加修饰,SIRT3 负责去除修饰,该修饰将糖酵解代谢物丙酮酸与转录调控联系起来,揭示了代谢与表观遗传之间的相互作用。

论文链接:
https://www.nature.com/articles/s42255-026-01556-2





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