Nature:利用数据独立采集质谱技术,构建人类蛋白质组定量图谱
人类基因组计划的完成,为我们提供了一份生命的“零件清单”。然而,从基因到功能,中间还隔着关键的一步——蛋白质。基因只是蓝图,真正执行生命功能的,是蛋白质。更重要的是,mRNA的丰度与蛋白质表达仅呈中等程度的相关性,这意味着仅靠基因测序,远不足以理解疾病。
2026年6月17日,西湖大学医学院附属杭州市第一人民医院郭天南团队、上海交通大学医学院松江研究院李岩团队以及哈尔滨医科大学心血管疾病国家重点实验室季勇团队共同在
Nature
发表了题为“
Spatial distribution of the proteome in human body and in cancers
”的研究论文,
该研究构建了一幅前所未有的
人类蛋白质组定量图谱
。研究团队利用数据独立采集质谱技术,对
2856份样本
中的超过
13000种蛋白质
进行了系统表征,覆盖了
58种主要健康组织类型
、251种组织亚型,以及
25种不同类型的癌变组织
及其配对邻近非肿瘤组织,还包括22种胎儿组织类型。

从“哪里表达”到“表达多少”
此前的人类蛋白质组研究大多局限于约30种组织,且多为半定量的抗体检测或有限样本的质谱分析。这项研究的突破在于其
广度
与
深度
的结合:它不仅几乎涵盖了所有人体的实体组织和主要体液,还通过DIA-MS技术实现了对数千种蛋白质的可靠、高通量定量。这使得科学家能够比较同一蛋白质在不同组织、不同生理状态(健康、胎儿、肿瘤)下的丰度变化。

人类蛋白组草案概述(图源自
Nature
)
三大应用价值
这一资源平台的建立,为生物医学研究提供了三个层面的支撑:
揭示发育与致癌机制
:通过比较胎儿、健康成人和肿瘤组织的蛋白质组轨迹,可以追溯发育过程中蛋白质表达的动态变化,以及这些程序如何在癌症中被异常重启或扭曲。
识别器官特异性毒性
:药物副作用往往具有器官特异性。通过了解蛋白质在不同组织中的基线表达水平,可以预测药物可能在哪一器官产生脱靶毒性。
发现可再利用的药物靶点
:跨癌种的蛋白质组比较,有助于识别那些在多种肿瘤中共同高表达的蛋白质,从而优先确定具有广谱治疗潜力的药物靶点。
科学意义:一座开放的“蛋白质谷歌地图”
这项研究的本质,是为科学界提供了一座
开放、定量、高分辨率的人类蛋白质组参考数据库
。它让研究者能够像使用地图一样,查询任何一个蛋白质在人体不同“地点”(组织)和“状态”(健康/疾病)下的分布与丰度。这将极大地加速我们对人类生物学的理解,并为精准医学时代的药物研发奠定坚实的基础。
本研究由多个团队协同完成。西湖大学医学院博士后岳靓、博士生姜玟昊、李赛男(现为
北京大学博士研究生
),以及
西湖大学访问学者
罗蒙为该研究的共同第一作者。西湖大学医学院郭天南教授、西湖实验室朱怡研究员、上海交通大学医学院李岩教授、哈尔滨医科大学季勇教授为该研究的共同通讯作者。
该研究得到了国家自然科学基金、浙江省
“尖兵领雁”研发攻关计划、科技创新
2030-
重大项目、上海市卫健委项目以及广东自然科学基金等多个项目的资助,以及西湖大学高性能计算中心提供的算力支持。本研究亦是“π
-HuB
(蛋白质组导航国际大科学计划)”的重要组成部分。
