Nat Med：潘翔宇等发现，靶向肠道真菌重塑IBD微生态并改善疾病活动

炎症性肠病（inflammatory bowel disease，IBD）主要包括溃疡性结肠炎（UC）和克罗恩病（CD）。长期以来，IBD微生物组研究和干预主要聚焦于细菌，而肠道真菌在疾病中的作用及其可干预性仍缺乏系统的人体证据。

2026年9月1日，Weill Cornell Medicine 潘翔宇为第一作者、Iliyan D. Iliev教授为通讯作者在

Nature Medicine

在线发表题为

Antifungal therapy improves microbiome dynamics in inflammatory bowel disease

的研究论文。

研究以伴有轻度口腔念珠菌病（鹅口疮）的IBD患者为切入点，比较仅局部作用于口腔的制霉菌素与可同时作用于口腔和胃肠道的氟康唑，发现真正靶向肠道真菌的氟康唑可降低肠道念珠菌负荷，并伴随有益细菌、抗炎代谢物及疾病活动状态的改善。

Nature Medicine

在线发表该研究。

口腔—肠道共享 Candida，为真菌分层提供临床入口

研究团队首先发现，在部分伴有口腔念珠菌病的IBD患者中，口腔与粪便分离的白色念珠菌（Candida albicans）在系统发育、单核苷酸变异及杂合性缺失特征上高度接近，提示同一菌株可能在口腔与肠道共同扩增。该结果不仅支持潜在的“口腔—肠道传播或共享定植”模式，也提示口腔真菌表现可作为识别部分肠道念珠菌异常患者的一个临床筛选入口。

图1｜IVAN研究设计、口腔—肠道共享 C. albicans 菌株及多组学纵向采样流程。

真正作用于肠道的抗真菌治疗才能显著降低念珠菌负荷

研究共纳入53例伴轻度口腔念珠菌病的轻至中度IBD患者，其中UC患者30例、CD患者23例。根据临床医生独立作出的常规治疗决策，18例接受制霉菌素“含漱后吐出”治疗（ORNT），35例接受口服氟康唑治疗（GIFT）。所有患者继续原有IBD治疗，并在治疗前及第2、4和8周进行纵向随访。

两种方案均能缓解口腔念珠菌病症状，但对肠道真菌的影响明显不同：局部制霉菌素并未降低粪便真菌负荷，也未显著改变肠道真菌群落；相比之下，氟康唑治疗后，大多数患者粪便中可培养念珠菌显著下降，多种机会致病真菌以及 C. albicans、C. parapsilosis 的丰度和检出率均减少。

图2｜氟康唑而非局部制霉菌素显著降低肠道念珠菌负荷。

靶向真菌触发跨界微生态重塑：有益细菌与抗炎代谢功能同步恢复

肠道真菌与细菌共同构成复杂的跨界生态网络。研究显示，氟康唑降低真菌丰富度的同时，细菌丰富度呈上升趋势；在全部患者中，C. albicans 丰度与细菌多样性呈负相关。

进一步宏基因组分析发现，氟康唑组中多种与肠道健康相关的短链脂肪酸产生菌逐渐增加，包括 Faecalibacterium prausnitzii、Roseburia hominis、Clostridium butyricum、Odoribacter splanchnicus 及多种 Eubacterium 菌。

这些群落变化进一步反映在代谢功能上：氟康唑组丁酸水平升高，并与 F. prausnitzii 的增加相一致；己酸、部分胆汁酸相关代谢物及脂肪酸代谢通路也呈恢复趋势。相反，制霉菌素组未出现相同方向的细菌和代谢恢复。因此，该研究揭示的并非单纯“清除真菌”，而是降低机会致病真菌的生态优势后，为有益细菌及其代谢功能的恢复释放空间。

图3｜氟康唑治疗后 F. prausnitzii 与丁酸相关变化，提示有益菌及抗炎代谢功能恢复。

微生态改善与疾病活动下降及较低疾病进展风险相关

在具有完整纵向临床数据的49例患者中，治疗结束时，氟康唑组81.8%（27/33）的患者疾病活动指数出现数值下降，而制霉菌素组为50.0%（8/16）；至第4周或第8周，氟康唑组这一比例达到94.0%（31/33），制霉菌素组为56.3%（9/16）。按照预设临床应答标准，氟康唑组45.5%（15/33）达到临床应答，高于制霉菌素组的25.0%（4/16）。

在8周随访期内，氟康唑组估计疾病进展概率为3.0%，而制霉菌素组为37.5%。跨组学相关分析进一步显示，念珠菌及微生物失调相关代谢物与疾病活动度正相关，而细菌多样性、健康相关菌群和丁酸产生菌与疾病活动度负相关。

由于本研究为前瞻性观察性队列而非随机对照试验，这些临床结果支持关联与转化假设，但仍需要进一步随机试验验证因果疗效。

图4｜UC和CD患者疾病活动度变化及8周疾病进展情况。

从真菌分层到精准辅助治疗：后续随机临床试验已启动

该研究提出了一种不同于广泛抑制微生物的精准策略：先识别具有真菌相关临床表现和肠道念珠菌扩增的患者，再通过短期或阶段性抗真菌干预降低机会致病菌株的优势占位，从而推动整个肠道生态系统重新建立稳态。这种策略可能无需永久清除共生真菌，便可产生更持久的细菌和代谢改善，同时有望减少长期用药和耐药选择压力。

基于本研究形成的临床假设，研究团队已进一步启动FUN-CD临床试验（NCT06274554），通过前瞻性、随机、安慰剂对照研究进一步检验“氟康唑+现有治疗”能否改善克罗恩病患者的临床结局。这意味着“真菌分层—精准抗真菌辅助治疗”策略已从观察性多组学证据进一步推进到随机临床试验验证阶段。

图5｜研究工作模型：靶向肠道真菌后，念珠菌下降并伴随细菌多样性、丁酸及疾病状态改善。

总结

总体而言，该研究将IBD中的肠道真菌从长期被忽视的微生物组成部分，推进为一个可检测、可分层且可能可干预的治疗靶点，并建立了从临床表型识别、真菌靶向干预、跨界微生态重塑到临床改善信号的完整转化链条，为未来在特定IBD亚群中探索抗真菌辅助治疗奠定了基础。

原文信息

• 论文题目：Antifungal therapy improves microbiome dynamics in inflammatory bowel disease

• 期刊：Nature Medicine

• 原文链接：https://www.nature.com/articles/s41591-026-04616-y

• 后续临床试验：FUN-CD，ClinicalTrials.gov NCT06274554