IF=81!瘤内细菌的“突变暗器”:重庆医科大学龙泉鑫/石小枫/黄爱龙/别梦军发现NDK借IRF3之手改写肺癌基因组
肿瘤微环境并非癌细胞的独角戏,其中还生活着大量细菌和真菌。过去研究发现,这些微生物能影响炎症和免疫,但一个关键问题始终悬而未决:它们能否直接改写肿瘤的DNA,推动基因组多样性?
2026年9月1日,重庆医科大学龙泉鑫、石小枫、黄爱龙及别梦军共同通讯在
Signal Transduction and Targeted Therapy
在线发表题为
Intratumoral Mycobacterium abscessus promotes cytidine deaminase mutagenesis in non-small cell lung cancer
的研究论文,该研究给出了肯定答案,并将矛头指向一种特殊的细菌效应蛋白。

研究团队对43例非小细胞肺癌患者的肿瘤及癌旁组织进行多组学分析,发现脓肿分枝杆菌(Mycobacterium abscessus)与APOBEC3A突变特征显著相关。
APOBEC3A是一种天然抗病毒酶,能将DNA中的胞嘧啶变为尿嘧啶,造成特征性突变;但在肿瘤中,它一旦被异常激活,就成了驱动耐药和异质性的“破坏者”。荧光原位杂交证实,这种细菌确实定居在肿瘤细胞内部。
那么,细菌如何激活APOBEC3A?团队筛选了23种细菌效应蛋白,锁定一个名为NDK的酶。机制上,NDK能结合宿主转录因子IRF3,并在其第263位组氨酸上添加一种罕见的1-磷酸组氨酸修饰。这一非经典修饰增强了I型干扰素信号,使APOBEC3A持续高表达,从而制造大量突变。实验显示,敲除NDK或突变IRF3的修饰位点,均能显著削弱这一效应。

肿瘤内M. abscessus与APOBEC3A的激活以及增强的肿瘤致突变有关(图源自
Signal Transduction and Targeted Therapy
)
更值得关注的是治疗转化。团队开发了一种靶向NDK的PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体),可选择性清除细菌内部的NDK,从而抑制APOBEC3A激活及相关突变表型。在异种移植和自发肺癌小鼠模型中,干扰NDK均能降低肿瘤负荷和突变水平。
这项研究揭示了“细菌效应蛋白→宿主组氨酸磷酸化→突变酶激活”的跨界信号轴,将瘤内微生物定植与肿瘤基因组进化直接相连。需客观指出,研究仍以细胞和动物模型为主,脓肿分枝杆菌在人类肺癌中的普遍性及其临床干预价值,还需更大规模队列验证。
但这一发现无疑为阻断微生物驱动的肺癌突变开辟了新思路——或许未来,靶向细菌蛋白的药物能成为抗癌工具箱中的新利器。
参考消息:https://www.nature.com/articles/s41392-026-02878-z
