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数据库乔治·丘奇愤而辞职，指责这家宣称“首次将AI设计噬菌体用于人类治疗“的公司，抢走合作者功劳
撰文丨王聪
编辑丨王多鱼
排版丨水成文
2026 年 10 月 20 日，AI 公司 Radical Numerics 宣布，利用其开发的一款跨 DNA、RNA、蛋白质及其他分子数据进行学习的多模态基因组语言模型——Omnii-1，设计了一种噬菌体，并将其通过同情用药方式用于一名耐药性细菌感染的人类患者。
这是全球首次将 AI 设计的噬菌体应用于人类患者，也标志着迈向针对耐药感染的个性化、AI 设计疗法的重要里程碑。该消息也在全球范围内引起了广泛关注。
然而，2026 年 11 月 6 日，著名生物医药媒体 Endpoints News 爆料，合成生物学及基因编辑技术先驱、哈佛大学教授乔治·丘奇（George Church）教授辞去 Radical Numerics 公司的顾问职务，并指责了该公司抢走合作者功劳的“卑劣”行为（Sleazy Behavior）。
乔治·丘奇
众所周知，抗生素彻底改变了医学，使过去致命的细菌感染变得可以常规治疗。但细菌会不断进化，通过突变和获得耐药基因而产生抗药性。多重耐药细菌正日益削弱抗生素的效果。2021 年，全球约有 470 万人的死亡与抗生素耐药性相关。预计在 2025-2050 年间，因抗生素耐药导致的死亡人数将接近 4000 万。
当抗生素失效时，噬菌体疗法提供了一种有前景的替代方案，噬菌体疗法的原理看起来并不复杂：找到能够杀死感染患者的细菌的噬菌体，并将其作为治疗手段。由于噬菌体只感染细菌而不感染人体细胞，因此噬菌体疗法通常被认为是安全的。与广谱抗生素不同，噬菌体能以极高的特异性靶向特定细菌，从而保护肠道中有助于消化的有益菌群。这种特异性既是噬菌体疗法的希望所在，也是其面临的挑战——治疗可以高度精准，但必须为每种感染找到或设计合适的噬菌体。
裂解性噬菌体的生命周期。噬菌体附着在细菌上，将其 DNA（橙色）注入细菌内，并产生新的噬菌体，当细菌细胞破裂时，这些噬菌体释放出来，并继续感染细菌。
目前，个性化噬菌体疗法在很大程度上依赖于经验性筛选，因为许多临床相关病原体所涉及的噬菌体-宿主特异性生物学机制尚未完全明确。
Radical Numerics 公司发布的文章显示，该公司训练了一款多模态基因组语言模型——Omnii-1，以帮助识别和设计靶向特定细菌菌株的噬菌体，从而为那些感染已无其他有效治疗手段的耐药菌的患者开发合适的噬菌体疗法。
Omnii-1 在多种基因组序列和多组学数据上进行预训练，随后进一步在噬菌体基因组上训练，以使其知识适应这些生物学系统。Omnii-1 在大肠杆菌 T7 噬菌体的基础上进行设计，主要重新设计了其 gp17 蛋白，即 T7 噬菌体的受体结合尾丝蛋白。该蛋白相当于噬菌体的“抓手”，通过抓住细菌表面受体来帮助入侵。
个性化噬菌体疗法开发流程
在实验室测试中，包含了 Omnii-1 设计的噬菌体变体的噬菌体混合物在体外成功清除了一名人类患者感染的耐抗生素菌株。随后，该噬菌体混合物通过由医生主导的同情用药途径应用于该患者的临床治疗。
然而，乔治·丘奇教授表示，Radical Numerics 公司的文章及相关报道中，完全没有提及一个重要合作方——Tabula Bio，这让外界认为这项“AI 设计的噬菌体应用于人类患者”的突破性工作完全归功于 Radical Numerics。
据 Endpoints News 报道，Tabula Bio 制备并测试了噬菌体疗法，联系了治疗医生并取得了监管机构的批准，从而推进了该噬菌体疗法的同情用药。Tabula Bio 在其官网所说的“公司成立六个月后，已经开始为真实患者提供治疗”，指的就是这项噬菌体疗法。
对于乔治·丘奇教授的指责，Radical Numerics 公司则表示，Tabula Bio 确实参与了该噬菌体疗法的开发和实验室工作，但之所以在文章和报道中没有提及这些工作，是因为保密条款，合作协议中要求对双方的合作关系保密。
Radical Numerics 公司由生物学 AI 模型 Evo 和 Evo2 开发团队的核心成员创立，该公司旨在开发能够理解、预测并设计生命分子系统的 AI 模型，其具有多元化的研究方向，包括疾病诊断、疫苗设计、抗体开发、噬菌体疗法，以及生物防御等等。
Tabula Bio 则孵化自乔治·丘奇实验室，该公司旨在利用 AI 终结传染病，随着致病微生物的不断进化，抗生素时代正在走向终结，而要想取得对抗传染病的永久胜利，不是开发出更好的抗生素，而是开发出一款 AI 算法——能够比微生物进化出耐药性更快地设计新的 DNA。
https://www.radicalnumerics.ai/blog/omnii-phage
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